『脳トレクエスト2』は、脳トレゲームを解いてモンスターを退治する脳トレRPGです。脳トレゲームの種類は本編を進めることでどんどん増える他、さまざまなスキルがついている装備品を身につけて自分だけのアバターを作ったり、フレンドを作ることで、バトル中にピンチになった時に助けてくれるのが本作の特徴となっています。